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薛定谔软件采购顺利完成
2014-04-15 13:45:37      点击:

2014410日下午14004政府采购项目评标会于我院科教楼719室顺利举行。成交公告已于中国政府采购网公示,详见链接:

http://cpms.ccgp.gov.cn/Bid.do?action=showById&type=detail&bidId=11454769

本次评标会涉及项目和部门:

序号           所属项目                部门

1             薛定谔软件          生理教研室于烨组  

本次采购的薛定谔软件主要应用于蛋白质和多肽的分子模拟应用。包含Maestro, Glide, LigPrep, Impact, Phase, Virtual Screening Workflow, Induced Fit Docking, QM-Polarized Ligand Docking, Covalent Docking, Biolumate, Prime, Desmond, MacroModel等模块。Glide模块包含三种模式,分别是:HTVS(高通量虚筛)模式,高精度对接上万至几十万配体的SP(标准精度)模式,以及通过更大规模的采样和更高级的打分函数进一步消除假阳性以获得更高富集率的XP(附加精度)模式。可以提供至少400个小分子的片段集(1-7个离子化或互变异构体;6-37个原子;分子量范围32-226)。LigPrep模块能够生成准确的,能量最优化的三维分子结构,纠正Lewis结构,消除配体分子的错误以减少下游计算中的错误。Phase模块提供完整的药效团建模软件工具,允许用户在作业的所有步骤进行精确的专家级设置,包括药效团评分、QSAR定量构效关系建立和数据库筛选等。能够利用受体蛋白晶体的三维结构信息来辅助产生药效团,定义受体占据的空间区域,从而排除配体存在的可能空间,搜索活性命中物的同时由小分子结构库创建一个三维构象数据库。

这套软件的购入有助于我院蛋白质和多肽的分子模拟应用研究的开展。